Era filho de Afonso Pereira, caçador-mor de D. Afonso V, do seu conselho e alcaide-mor de Santarém. e de sua segunda mulher, D. Catarina Coutinho, filha dos segundos condes de Marialva. Serviu no reino, na África, na Índia e na América. Foi capitão de Goa a 27 de janeiro de 1521, do conselho de João III em 1531, e teve, em galardão dos seus serviços, a 5 de abril deste mesmo ano, a capitania da Baía de Todos os Santos, no Brasil, de juro e herdade, sendo um dos donatários, entre os quais foi dividido o Brasil por D. João Ill. Era já velho quando foi tomar passe do território que lhe fora distribuído. Violento por índole, e desprezador da selvagem bravura dos Tupinambas, como quem estava costumado a medir-se com mais terríveis inimigos, quis levar tudo a ferro e a fogo, e não conseguiu senão ver o seu estabelecimento de Vila Velha destruído pelos indígenas. Sucumbiu a uma revolta dos indígenas em 1549. 

Era casado com D. Margarida Pereira de Lacerda, filha de Reimão Pereira de Lacerda e de D. Isabel Pereira.