A tentativa de Organização militar no reinado de D. João III

A organização teve uma tentativa de renovação em setembro de 1525, devido à crise diplomática com a Espanha provocada pela Questão das Molucas, que teve um primeiro rebate em 1524, quando as conversações em Elvas se romperam. Este momento, decisivo no relacionamento entre os dois países peninsulares, em que Portugal começou a afastar-se da política de colaboração com Espanha iniciada por D. João II na defesa do autoproclamado monopólio ibérico da navegação no Atlântico Sul, foi-o também na organização das Ordenanças, já que a oposição dos estratos sociais intermédios das províncias à integração nas companhias foi enorme e, pelo menos de acordo com os dados atualmente disponíveis, impossível de ultrapassar¹. 

Mas a oposição não se fez sentir só no interior do país. Em Marrocos e no Oriente, a nobreza conseguiu “com o apoio dos seus representantes junto da Coroa, a dissolução destes corpos militares”². Só mais tarde, em 1540, “se assistirá à criação de companhias organizadas segundo o modelo das ordenanças”³. 

Mas, só no início do governo pessoal de D. Sebastião, com base no aparecimento de um poder central mais forte do que até aí e duma nova teoria do poder real, se conseguiu ultrapassar a oposição das classes privilegiadas dos concelhos e criar uma estrutura que, separando o “povo miúdo” da “gente da governança das terras”, e baseando-se nas estruturas locais – sobretudo nos concelhos, mas também nas honras, coutos e outras jurisdições – permitisse criar um sistema de recrutamento e instrução militar básica em todo o país.